La fauna de la costa del lago es típica de la región de Siberia Oriental. Naturaleza relativemente intacta, pocos turistas y gran espacio de bosques permiten conservar el gran número de los animales. Entre los animales carnívoros los más extendidos son lobos, zorras, osos y cebellinas. Bastante frecuentes son los encuentros con osos, pero sólo en los lugares de la infraestructura turística poca desarrollada.

A comienzos de abril, cuando estos animales salen de sus albergues para disfrutarse del sol y de la hierba primera, así como recoger los conos de cedro y derrotar los hormigueros. En verano los osos prefieren lugares de vegetación densa, por ejemplo, valles de ríos, arroyos y prados. Los sitios más favoritos son los prados subálpicos de las cordilleras que rodean el Baikal – Jamar-Dabán, Baikalsky y Barguzinsky. En los cursos superiores de los ríos, en el fondo de los valles siempre se puede ver dos o tres osos que están buscando la comida. Estos animales nunca pierden el momento favorable para captar a los ungulados. Cuando los prados se hacen secos, los osos se dirigen a la taiga para comer bayas (vaccinio, arándano azul). Más tarde, cuando las nueces de cedro se hacen maduras, los animales se marchan a los bosques de cedro para aumentar su grasa antes de la llegada de invierno. Los osos se van a los albergues a finales de octubre y a comienzos de noviembre. Se amodorran hasta marzo y abril. En invierno la osa pare a los cachorros.

Cebellina y garduña son los habitantes típicos de la taiga de coníferas que se alimentan con roedores, bayas y nueces. Para guardar la populación de la cebellina en Rusia fue fundado el primer coto llamado Barguzinsky. Entre los cornívoros mayores se puede rara vez ver glotón que es un animal interesante, recatado y parecido tanto al oso como al tejón. Los glotones se alimentan con los restos de la caza de lobos, y es muy rara vez que se cazan por si mismos. En las fronteras de bosques están extendidos ermiños y collarejas. Estos animales menores a pesar de sus tamaños pequeños son los cornívoros muy furiosos. Con los depósitos de agua están relacionados tales cornívoros raros como nutria de río y visón americano aclimatizado allí en los años 50. El último ocupó parcialmente los lugares habitables por otro animal - kolonok y compite con este en alimentación. Se encuentran muy rara vez tejones, así como linces para los que son necesarios los espacios vastos para cazarse. El tipo poco numeroso que habita el territorio del Baikal es el babre de nieve. Es el animal único por su belleza que vive en los Sayanes Orientales. Hay testimonios no verificados sobre que también se puede encontrarlo en las cordilleras Barguzinsky y Jamar-Dabán.

Entre los animales ungulados los más numerosos son ciervos comunes de Siberia. En verano los ciervos se reunen en los prados alpinos escapándose de los mosquitos de taiga en las crestas de nieve. En los bosques de coníferas claras muy a menudo se encuentran corzas que están disfrutándose del sol. En el bosque de coníferas oscuras – almizclero que es el pequeño animal patihendido con largas piernas traseras y con los colmillos superiores de los machos. Almizclero habita en los vertientes rocosos y abruptos y se alimenta con hierbas, liquen y musgo.

Todo esto territorio es la casa para alces que son los animales bastante grandes. Prefieren alimentarse con las plantas de agua, sabe nadar muy bien y debido a eso se encuentran muy a menudo cerca de los lagos de bosque. Son frecuentes los casos del encuentro con puercos que prefieren habitar en los valles de ríos y arroyos, en los vertientes abiertos de estepas, así como en los bosques de coníferas en verano e invierno. En otoño se acumulan en los bosques de cedro y se quedan allí hasta la nieve.

A los tipos raros de los ungulados se refieren cabrones de montes Siberiano que habitan en los Sayanes Orientales y en la Cordillera Barguzinsky. Además, en la zona de altes montes habita el subtipo del reno (la población de Altay-Sayanes). Entre los animales menores se destacan, ante todo, ardillas, liebres blancos, ratones de bosque, musarañas, grises, campañoles, citilos y unos otros. Más raro se encuentran topos, murciélagos y marmotas que viven en las orillas del lago.

Los pájaros son los representantes de la fauna del Baikal más notables y numerosos. Las condiciones climáticas que son bastante variables creen el ambiente favorable para la vida de los habitantes de taiga, de los lagos y pantanos, así como de los de altos montes. El gran espacio ácuaeo e islas contribuyen mucho a la nidificación de la gran cantidad de los tipos acuáticos. Entre ellos los más notables son gaviotas (grises azulados), patos (pequeño somormujo negro-blanco) cercetas, áñades y ocas de bosque de color naranja (ogar). En cuanto a los pájaros cornívoros están representados ratoneras comunes, gavilanes, milanos negros, alcones y cernícalos. Es rara suerte observar águilas de mar, áquilas de estepa, águila enano, busardo y unos otros. Los bosques están llenos de urogallos, cortezas y gallos silvestres. Reclamo de los urogallos empieza a partir del 15-20 de abril. Se puede mencionar la migración estacional de estos pájaros que está bien expresada. La gran mayoría de los pájaros en otoño habita en los bosques de monte y en los de cedro. En la tudra de monte se puede ver los bancos de perdices blancos. De los pájaros mayores en el territorio del Baikal habitan grullas, garzas grises y cigueñas (que a veces se encuentra en la isla Oljón). Todo el verano los bosques están llenos de gorjeos aflautados de pájaros. Los participantes más activos de tales “conciertos” son aves tontas, ruiseñores, paros y pinchones. Los sonidos característicos hacen cuclillos, pájaros carpinteros, grajos y cascanueces. A lo largo de las orillas abruptas y en las aldeas costales muy a menudo se ven golondrinas.

Entre los reptiles y anfibíos en dado territorio habitan las 11 especies. En los lugares húmedos es posible ver muy a menudo ranas de Siberia y ranas de hocico apuntado, hinóbidos Siberiano que son anfibíos parecidos a tritón, así como ranas de Mongolia, víboras y culebras. En los terrenos rocosos de estepas, a lo largo de los vertientes sureños abruptos de la costa de la isla Oljón se puede observar como los serpientes de varios tipos (culebra) están disfrutándose del sol. Y, claro que, en todas partes se ven lagartos vivíparos.